בחזונה של האגודה ידע מדעי בנושאי הסביבה בישראל משמש כבסיס איתן לתהליכי קבלת החלטות במישור הלאומי והמקומי. ידע זה צריך להיות זמין ונגיש לעובדי ציבור, לארגוניים אזרחיים לציבור הרחב ולהשתלב בקידום מדיניות סביבתית מושכלת לשיפור מצב הסביבה בישראל.
לעודד, לפתח ולהפיץ את מדעי איכות הסביבה והאקולוגיה בישראל ולחזק את מעמד הקהילה המדעית בזירה הציבורית.
להגביר את המודעות לסוגיות סביבתיות ולקדם את החינוך הסביבתי בקרב הציבור.
להביא ידע ותובנות מדעיות רלוונטיות בתחומי האקולוגיה ואיכות הסביבה בפני מקבלי החלטות בעלי עניין, לטובת החברה ולשיפור מצב הסביבה בישראל ואזור.
לפתח את הממשקים ההדדיים שבין הקהילה המדעית לבין גופים ורשויות האמונים על קבלת החלטות לטובת קידום מדיניות סביבתית מתקדמת המתאימה למאה ה21 במדינת ישראל